苏北人民医院肝胆胰内科同时是省级临床重点专科消化内科和肝胆胰中心的重要组成份，2008年开始成立病区，分为肝病和胆胰两个专业组。2012年2月与普外肝胆胰病区融合，组建肝胆胰中心，消化科肝病及胆胰专业组成为肝胆胰中心内科组，包括肝脾内科组及胆胰内科组，实际开放床位61张。肝胆胰中心内科组现有8位医师，其中博士3人，硕士5人，副教授3人，硕士生导师2人，主任医师2人，副主任医师3人，主治医师3人。3人为省市级专业学会委员，江苏省“333”工程培养对象1人，扬州市卫生系统学术技术带头人1名。常规开展省级临床重点专科所有一般技术及重点技术：内镜下十二指肠乳头括约肌切开胆总管取石术、胆总管狭窄支架置入术在内的数十项ERCP相关技术，内镜下食道胃底静脉曲张套扎、硬化剂及组织胶注射治疗，门脉高压症经颈静脉门体分流术，原发性肝癌经肝动脉插管化疗栓塞术，超声引导下的各种肝脏穿刺诊疗操作包括肝穿刺活检、肝癌射频消融术、肝囊肿肝脓肿穿刺抽液等，超声胃镜引导下的肝胆胰及腹膜后病变的诊疗操作。上述多数技术项目在苏中地区领先，在省内乃至国内处于先进行列。近三年先后有5人次分别赴德国、以色列、台湾地区及国内上海东方肝胆外科医院、长海医院、上海肿瘤医院、南京鼓楼医院访问、进修学习。2013年完成经内镜逆行性胰胆管造影（ERCP）手术近600人次，内镜下食道胃底静脉曲张套扎、硬化剂及组织胶注射治疗150多人次，肝脏穿刺活检及脓肿/囊肿穿刺引流术23人次。肝胆胰内科的业务辐射范围遍及扬州地区各个县市区以及泰州、淮安及安徽天长等地区。近三年先后承办国家级继续医学教育项目1次，省级继续教育项目2次，市级继续教育项目1次。近五年获得江苏省卫生厅预防医学课题1项，扬州市科技局课题1项，院级课题3项，作为第二负责人获得国家自然科学基金课题3项；获得扬州市科技进步三等奖1项，扬州市卫生局新技术引进奖2项。肝胆胰内科常年开设专家门诊。