功能检查科在院领导及各职能科室的指导与帮助下于2014年7月正式成立，为扬州市重点专科。功能检查科由心电图室、动态心电图室、超声心动图室、神经电生理室等共四个部门组成，检查项目包括：常规心电图、运动平板试验、动态心电图、动态血压、超声心动图、四肢血管多普勒、肌电图、脑电图、颅内多普勒超声、脑干听觉电位诱发实验等。

科室技术力量雄厚、设备先进，拥有各类大中型检查设备数百万元。现科室共有医务人员29人，其中主任医师1人，副高职称3人，中级职称5人，主管技师3人；硕士学位20人。

心电图检查室于2001年率先在扬州地区采用12通道心电图检查仪，为同步观测心律失常的诊断提供了有力的帮助。2011年初亦建立了扬州地区唯一的心电工作站系统，为心血管疾病患者的资料保存及动态随访提供了极大的便利。

血管功能检查室是目前扬州地区唯一开展早期动脉硬化检测的科室，能准确地发现早期血管变异情况。运动平板检查对冠心病的早期发现提供了诊断手段。

动态心电图及血压检查室的动态心电图分析仪采用美国PI公司三通道动态心电图分析仪，对心律失常和冠心病提供了动态的监测，动态血压检查对血压不稳定患者提供24小时监测。

超声心动图室拥有先进超声诊断仪，常规开展先天性心脏病、冠心病、心脏瓣膜疾病以及外周血管的检查。率先在扬州地区开展了在超声引导下先天性心脏病的介入治疗手术、经食管常规超声心动图检查、经食管三维超声心动图检查、心肌同步化检测、右心声学造影检查等。

神经电生理室拥有日本光电公司的脑电仪2台、肌电图诱发电位仪2台，德国DWL公司生产的超声经颅多普勒血流分析仪1台及美国CAD公司生产的数字化脑电图分析系统1台，目前已展开常规脑电图、动态脑电图、脑血流图、肌电图及诱发电位检查，年接诊人次1.5万人以上。2010年我科TCD规范化操作，并通过卫生部“脑卒中筛查与防治”中心的检查，医院脑卒中中心顺利挂牌，成为江苏省地级市唯一的卫生部认可的脑卒中筛查基地。2015年被评为全国100强高级脑卒中中心。